B.1.617 SARS COV-2 variantas: Virulentiškumas ir skiepų pasekmės

B.1.617 variantas, sukėlęs pastarąją COVID-19 krizę Indijoje, buvo susijęs su padidėjusiu ligos plitimu tarp gyventojų ir kelia didelį iššūkį ligos sunkumui ir šiuo metu turimų vakcinų veiksmingumui. 

COVID-19 padarė precedento neturinčios žalos visame pasaulyje tiek socialine, tiek ekonomine prasme. Kai kurios šalys taip pat patyrė antrąją ir trečiąją bangas. Pastaruoju metu Indijoje padaugėjo atvejų, o pastarąjį mėnesį maždaug nuo trijų iki keturių šimtų tūkstančių atvejų kasdien užfiksuota. Neseniai išanalizavome, kas galėjo nutikti dėl COVID krizės Indijoje¹. Be socialinių ir kultūrinių veiksnių, kurie galėjo lemti pakilimą, pats virusas mutavo taip, kad atsirado labiau užkrečiamas nei anksčiau variantas. Šiame straipsnyje aprašoma, kaip galėjo atsirasti naujasis variantas, jo liga, sukelianti potencialą ir pasekmes vakcinos veiksmingumui, ir kokių veiksmų galima imtis siekiant sumažinti jo poveikį vietiniu ir pasauliniu mastu ir užkirsti kelią tolesniam naujų variantų atsiradimui. 

B.1.617 m variantas pirmą kartą pasirodė 2020 m. spalį Maharaštros valstijoje ir nuo tada išplito maždaug 40 šalių, įskaitant Jungtinę Karalystę, Fidžį ir Singapūrą. Per pastaruosius kelis mėnesius ši padermė tapo dominuojančia paderme visoje Indijoje ir ypač per pastarąsias 4–6 savaites buvo atsakinga už labai padidėjusį infekcijų skaičių. B.1.617 turi aštuonias mutacijas, iš kurių 3 mutacijos, būtent L452R, E484Q ir P681R, yra pagrindinės. Tiek L452R, tiek E484Q yra receptorių surišimo domene (RBD) ir yra atsakingi ne tik už prisijungimo prie ACE2 receptorių padidėjimą.² padidina pernešamumą, bet taip pat atlieka antikūnų neutralizavimo vaidmenį³. P681R mutacija žymiai padidina sincito susidarymą, o tai gali prisidėti prie padidėjusios patogenezės. Dėl šios mutacijos virusinės ląstelės susilieja, sukuriant didesnę erdvę virusui daugintis, o antikūnams sunku juos sunaikinti. Be B.1.617, infekcijos dažnio padidėjimą galėjo sukelti dar dvi padermės, B.1.1.7 m Delyje ir Pendžabe ir B.1.618 Vakarų Bengalijoje. B.1.1.7 padermė pirmą kartą buvo identifikuota JK 2020 m. antroje pusėje ir turi N501Y mutaciją UBR, dėl kurios padidėjo jo pernešamumas dėl sustiprinto prisijungimo prie ACE2 receptorių.⁴. Be to, jis turi kitų mutacijų, įskaitant dvi delecijas. B.1.1.7 iki šiol išplito visame pasaulyje ir įgijo E484R mutaciją JK ir JAV. Įrodyta, kad E484R mutanto jautrumas imuniniams serumams iš asmenų, paskiepytų Pfizer mRNR vakcina, sumažėja 6 kartus ir 11 kartų sumažėja jautrumas sveikstantiems serumams.⁵. 

Nauja viruso padermė su pridėtomis mutacijomis gali atsirasti tik tada, kai virusas užkrečia šeimininkus ir replikuojasi. Tai veda prie „tinkamesnių“ ir infekcinių variantų atsiradimo. To buvo galima išvengti, užkertant kelią žmogaus perdavimui, laikantis saugos protokolų, tokių kaip socialinis atsiribojimas, tinkamas kaukių naudojimas viešose / perpildytose vietose ir pagrindinių asmens higienos gairių. B.1.617 atsiradimas ir išplitimas rodo, kad šių saugos gairių galėjo būti nesilaikoma griežtai.  

B.1.617 štamą, sukėlusią sumaištį Indijoje, Pasaulio sveikatos organizacija (PSO) priskyrė „susirūpinimą keliančiam variantui (LOJ)“. Ši klasifikacija pagrįsta padidėjusiu sunkios ligos užkrečiamumu ir plitimu pagal variantą.  

Tyrimuose su gyvūnais, naudojant žiurkėnus, nustatyta, kad B.1.617 padermė sukelia stipresnį uždegimą nei bet kurie kiti variantai⁶. Be to, šis variantas atsirado dėl padidėjusio ląstelių linijų efektyvumo in vitro ir neprisijungė prie bamlanivimabo – antikūno, naudojamo COVID-19 gydymui.⁷. Gupta ir jo kolegų atlikti tyrimai parodė, kad nors neutralizuojantys antikūnai, kuriuos sukūrė asmenys, paskiepyti Pfizer vakcina, buvo maždaug 80 % mažiau veiksmingi prieš kai kurias B.1.617 mutacijas, vakcinacija netaptų neveiksminga.³. Šie tyrėjai taip pat nustatė, kad kai kurie sveikatos priežiūros darbuotojai Delyje, kurie buvo paskiepyti Covishield (Oxford-AstraZeneca vakcina), vėl užsikrėtė B.1.617 paderme. Papildomi Stefano Pohlmanno ir kolegų tyrimai⁷ naudojant serumą iš žmonių, kurie anksčiau buvo užsikrėtę SARS-CoV-2, nustatė, kad jų antikūnai neutralizuoja B.1.617 maždaug 50 % mažiau efektyviai nei anksčiau cirkuliavusių padermių. Kai buvo tiriamas serumas iš dalyvių, kurie buvo paskiepyti du kartus Pfizer vakcina, paaiškėjo, kad antikūnai prieš B.67 buvo maždaug 1.617 % silpnesni. 

Nors pirmiau minėti tyrimai rodo, kad B.1.617 turi pranašumą prieš kitas viruso padermes dėl didesnio perdavimo ir tam tikru mastu išvengimo neutralizuojančių antikūnų, remiantis serumo antikūnų tyrimais, tikroji padėtis organizme gali skirtis dėl didžiulis gaminamų antikūnų skaičius ir tai, kad padermės mutacijos gali nepaveikti kitų imuninės sistemos dalių, tokių kaip T ląstelės. Tai parodė B.1.351 variantas, kuris buvo susijęs su didžiuliu neutralizuojančių antikūnų stiprumo sumažėjimu, tačiau tyrimai su žmonėmis rodo, kad vakcinos vis dar veiksmingos užkertant kelią sunkioms ligoms. Be to, tyrimai, naudojant Covaxin, taip pat parodė, kad ši vakcina ir toliau yra veiksminga⁸, nors šiek tiek sumažėjo neutralizuojančių antikūnų, kuriuos sukuria Covaxin vakcina, veiksmingumas. 

Visi aukščiau pateikti duomenys rodo, kad reikia atlikti daugiau tyrimų, kad būtų galima suprasti dabartinių vakcinų veiksmingumą ir sukurti būsimas versijas, pagrįstas naujų padermių atsiradimu, kurios gali bandyti išvengti imuninės sistemos savo naudai. Nepaisant to, dabartinės vakcinos ir toliau yra veiksmingos (nors gali būti ne 100%), kad būtų išvengta sunkių ligų, o pasaulis turėtų kuo anksčiau siekti masinės vakcinacijos ir tuo pat metu stebėti atsirandančias padermes, kad būtų galima imtis būtinų ir imtis reikiamų veiksmų kuo anksčiau. Taip būtų užtikrinta, kad gyvenimas greičiau grįš į įprastas vėžes. 

***

Nuorodos:  

1. Soni R. 2021. COVID-19 krizė Indijoje: kas galėjo nutikti. Mokslinis Europos. Paskelbta 4 m. gegužės 2021 d. Prieiga internete adresu http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/covid-19-crisis-in-india-what-may-have-gone-wrong/ 

2. Cherianas S et al. 2021 m. Konvergentiška SARS-CoV-2 smailių mutacijų L452R, E484Q ir P681R raida antrojoje COVID-19 bangoje Maharaštroje, Indijoje. Išankstinis spausdinimas svetainėje bioRxiv. Paskelbta 03 m. gegužės 2021 d. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.04.22.440932   

3. Ferreira I., Datiras R., et al 2021 m. SARS-CoV-2 B.1.617 atsiradimas ir jautrumas vakcinos sukeltiems antikūnams. Išankstinis spausdinimas. BioRxiv. Paskelbta 09 m. gegužės 2021 d. DOI: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.08.443253v1  

4. Gupta R K. 2021. Ar susirūpinimą keliantys SARS-CoV-2 variantai turės įtakos vakcinų pažadui? Nat Rev Immunol. Paskelbta: 29 m. balandžio 2021 d. DOI: https://doi.org/10.1038/s41577-021-00556-5 

5. Collier DA ir kt. 2021 m. SARS-CoV-2 B.1.1.7 jautrumas mRNR vakcinos sukeltiems antikūnams. Gamta https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7. 

6. Yadav PD et al. 2021 m. SARS CoV-2 B.1.617.1 variantas yra labai patogeniškas žiurkėnams nei B.1 variantas. Išankstinis spausdinimas svetainėje bioRxiv. Paskelbta 05 m. gegužės 2021 d. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.05.442760   

7. Hoffmannas M et al. 2021 m. SARS-CoV-2 variantas B.1.617 yra atsparus bamlanivimabui ir vengia antikūnų, kuriuos sukelia infekcija ir vakcinacija. Paskelbta 05 m. gegužės 2021 d. Preprint at bioRxiv. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442663   

8. Yadav PD et al. 2021 m. Tiriamo varianto B.1.617 neutralizavimas BBV152 vakcinuotų asmenų serumais. Paskelbta: 07 m. gegužės 2021 d. Klin. Užkrėsti. Dis. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciab411   

***