Žmogaus proteomo projektas (HPP): planas, apimantis 90.4 % išleisto žmogaus proteomo

Žmonių „Proteome Project“ (HPP) buvo pradėtas sėkmingai užbaigti 2010 m Žmonių Genomo projektas (HGP), skirtas identifikuoti, apibūdinti ir nustatyti žmogaus proteomas (visas baltymų, išreikštų žmogaus genomas). Per savo dešimtmetį HPP išleido pirmąjį itin griežtą projektą, apimantį 90.4 proc. žmogaus proteomas. Kaip gyvenimo kodas, šis etapas turi labai reikšmingų pasekmių žmogaus sveikata ir terapija.   

Baigta 2003 Žmonių Genome Project (HGP) buvo tarptautinis bendradarbiavimas, įkurtas 1990 m., siekiant nustatyti visą žmogaus genus ir nustatyti visą DNR bazių seką žmogaus genomo. 15 m. sausio 2001 d. HGP paskelbė pradinę seką ir analizę žmogaus genomo. Identifikavimas, apibūdinimas ir kartografavimas žmogaus proteomas (visas genomo koduotas baltymų komplementas) buvo kitas logiškas žingsnis. Todėl, Žmonių Proteome Organization (HUPO) buvo įkurta 9 m. vasario 2001 d., siekiant skatinti proteomikos tyrimus. 23 m. rugsėjo 2010 d. HUPO oficialiai pradėjo veikti Žmonių Proteome projektas (HPP), kurio tikslas - parengti projekto projektą žmogaus proteomas ⁽¹⁾.  

Programos analizė žmogaus genomas prognozuoja apie 20,300 XNUMX baltymus koduojančių genų. Visas šių genų koduojamų baltymų rinkinys sudarožmogaus proteomas'. Žmonių proteomas yra daug didesnis nei „žmogaus genomas“, nes vienas genas gali būti išreikštas įvairiomis formomis (proteoformomis) dėl cheminių modifikacijų transliacijos metu ir po jos. Apskaičiuota, kad viename individe gali egzistuoti milijonas proteoformų. 2010 m., HE pradžioje, buvo nustatyta vos 70% baltymų, numatytų genomo analizės metu. Proteome projekto darbotvarkė buvo užpildyti šią žinių spragą. Tobulėjant technologijoms, tapo įmanoma tiksliau aptikti ir kiekybiškai įvertinti baltymus ir jų formas. Vis dėlto trūksta daug baltymų (baltymai numatė genomo analizė, bet vis dar neaptikta) ^(2,3). Projektas vis dar vykdomas; tačiau pasiektas svarbus etapas. 

16 m. spalio 2020 d., per savo dešimtmetį, HPP išleido pirmąjį itin griežtą projektą, apimantį 90.4 % žmogaus proteomo. ⁽¹⁾. Tai žymiai pagerina mūsų žinias apie žmogaus biologiją ir supratimą apie molekulinius mechanizmus ląstelių ir molekulių lygiu, ypač žmogaus proteomo vaidmenį, kuris tiesiogiai lemia vėžio, širdies ir kraujagyslių bei infekcinių ligų diagnostikos ir gydymo metodų tyrimus ir plėtrą, ypač individualiems ir tikslioji medicina ⁽⁴⁾. 

Žmogaus vystymasis Baltymų Atlas yra labai reikšminga pažanga tolesniems tyrimams žmogaus diagnostikos ir terapijos srityje ^(5,6).  

***

Nuorodos:

1. HUPO 2021. Proteomikos laiko juosta. Galimas https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Žmogaus proteomas. Galima internetu adresu https://www.nextprot.org/about/human-proteome Prieiga 30 m. gruodžio 2020 d. 

3. Inserm, 2020. Proteomika: gyvenimo kodas, išverstas daugiau nei 90 proc. Paskelbta 07 m. gruodžio 2020 d. Prieiga internete adresu https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Prieiga 30 m. gruodžio 2020 d.  

4. Adhikari, S., Nica, EC, Deutsch, EW ir kt. 2020. Labai griežtas žmogaus proteomo projektas. Paskelbta: 16 m. spalio 2020 d. Gamtos komunikacija 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A. ir Lindskog C., 2020. Žmogaus baltymų atlasas – žmogaus proteomo erdvinė lokalizacija sveikatai ir ligoms. Protein Science 30 tomas, 1 leidimas. Pirmą kartą paskelbta: 04 m. lapkričio 2020 d. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. Žmogaus baltymų atlasas 2020. Žmogaus baltymų atlasas Galima rasti internete adresu https://www.proteinatlas.org/about Prieiga 30 m. gruodžio 2020 d. 

***