Biologinio ir skaičiavimo metodų derinys, skirtas tirti baltymų ir baltymų sąveiką (PPI) tarp viruso ir šeimininko baltymų, siekiant nustatyti ir pritaikyti vaistus veiksmingam COVID-19 ir galbūt kitų infekcijų gydymui.
Įprastos kovos su virusinėmis infekcijomis strategijos apima antivirusinių vaistų ir vakcinų kūrimą. Dabartinės precedento neturinčios krizės, su kuria pasaulis susiduria dėl SARS-CoV-2 viruso sukeltos COVID-19 , metu abiejų aukščiau paminėtų metodų rezultatai atrodo gana tolimi, kad duotų kokių nors vilčių teikiančių rezultatų.
Tarptautinių tyrėjų komanda neseniai (1) pritaikė naują metodą (pagrįstą tuo, kaip virusai sąveikauja su šeimininkais), skirtą „perdirbti“ esamus vaistus, nustatant naujus kuriamus vaistus, kurie galėtų padėti veiksmingai kovoti su COVID-19 infekcija. Siekdami suprasti, kaip SARS-CoV-2 sąveikauja su žmonėmis, tyrėjai, naudodami biologinių ir skaičiavimo metodų derinį, sukūrė žmogaus baltymų, su kuriais virusiniai baltymai sąveikauja ir kuriuos jie panaudoja infekcijai sukelti žmonėms, „žemėlapį“. Tyrėjams pavyko nustatyti daugiau nei 300 žmogaus baltymų, kurie sąveikauja su 26 tyrime naudotais virusiniais baltymais (2). Kitas žingsnis buvo nustatyti, kurie iš esamų ir kuriamų vaistų galėtų būti „ perdirbti “ COVID-19 infekcijai gydyti, nukreipiant juos į tuos žmogaus baltymus.
Tyrimo metu buvo nustatytos dvi vaistų klasės, galinčios veiksmingai gydyti ir sumažinti COVID-19 ligą: baltymų transliacijos inhibitoriai, įskaitant zotatifiną ir ternatiną-4/plitidepsiną, ir vaistus, kurie yra atsakingi už Sigma1 ir Sigma 2 receptorių baltymų moduliavimą organizme. ląstelė, įskaitant progesteroną, PB28, PD-144418, hidroksichlorokviną, antipsichozinius vaistus haloperidolį ir kloperaziną, sirameziną, antidepresantą ir vaistą nuo nerimo bei antihistamininius vaistus klemastiną ir kloperastiną.
Iš baltymų transliacijos inhibitorių stipriausias antivirusinis poveikis in vitro prieš COVID-19 buvo pastebėtas naudojant zotatifiną, kuris šiuo metu yra klinikiniuose vėžio tyrimuose, ir ternatino-4/plitidepsino, kurį FDA patvirtino daugybinei mielomai gydyti.
Tarp vaistų, moduliuojančių Sigma1 ir Sigma2 receptorius, antipsichozinis haloperidolis, vartojamas šizofrenijai gydyti, pasižymėjo antivirusiniu poveikiu prieš SARS-CoV-2. Du stiprūs antihistamininiai vaistai, klemastinas ir kloperastinas, taip pat parodė antivirusinį aktyvumą, kaip ir PB28. PB28 rodomas antivirusinis poveikis buvo maždaug 20 kartų didesnis nei hidroksichlorokvino. Kita vertus, hidroksichlorokvinas parodė, kad, be nukreipimo į Sigma1 ir -2 receptorius, jis taip pat jungiasi su baltymu, žinomu kaip hERG, žinomo kaip reguliuojantis elektrinį širdies aktyvumą. Šie rezultatai gali padėti paaiškinti galimą riziką, susijusią su hidroksichlorokvino ir jo darinių naudojimu kaip galimą COVID-19 gydymą.
Nors pirmiau minėti in vitro tyrimai davė daug žadančių rezultatų, „pudingo įrodymas“ priklausys nuo to, kaip šios potencialios vaistų molekulės pasiseks klinikiniuose tyrimuose ir netrukus bus patvirtintas COVID-19 gydymas. Tyrimo unikalumas yra tas, kad jis praplečia mūsų žinias apie mūsų pagrindinį supratimą apie viruso sąveiką su šeimininku, todėl identifikuojami žmogaus baltymai, sąveikaujantys su viruso baltymais, ir atskleidžiami junginiai, kurių kitu atveju nebūtų buvę akivaizdu tirti virusinėje aplinkoje.
Ši informacija, atskleista šio tyrimo metu, ne tik padėjo mokslininkams greitai nustatyti perspektyvius vaistų kandidatus klinikiniams tyrimams atlikti, bet ir gali būti panaudota norint suprasti ir numatyti klinikoje jau atliekamo gydymo poveikį, taip pat gali būti išplėsta, kad būtų galima atrasti vaistus prieš kitus. virusinės ir nevirusinės ligos.
***
Nuorodos:
1. Pasteur institutas, 2020. Atskleidimas, kaip SARS-COV-2 užgrobia žmogaus ląsteles; Nurodo vaistus, turinčius potencialą kovoti su COVID-19, ir vaistą, kuris skatina jo infekcinį augimą. PRANEŠIMAS SPAUDAI Paskelbta 2020 m. balandžio 30 d. Prieinama internete adresu https://www.pasteur.fr/en/research-journal/press-documents/revealing-how-sars-cov-2-hijacks-human-cells-points-drugs-potential-fight-covid-19-and-drug-aids-its Prieiga peržiūrėta 2020 m. gegužės 06 d.
2. Gordon, DE ir kt. 2020. SARS-CoV-2 baltymų sąveikos žemėlapis atskleidžia vaistų pakartotinio panaudojimo taikinius. „Nature“ (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2286-9
***

Komentarai yra uždaryti.